2018年9月 —— 平凡的高中生们正在为各自的前途奋战。明光院景都正为了梦想的柔道金牌而努力，然而，他在比赛中受伤，从此再难踏上柔道选手之路。明光院心灰意冷之时，神秘的青年突然出现并拿出手表及驱动器……此外，班级里也突然来了一位名为海东大树的转学生……错综复杂的阴谋，层层交叠的陷阱。等待着明光院、庄吾还有月读的，究竟是什么样的未来?

一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。

在一千年前，人类和恶灵互相战斗著。人类藉著圣兽的帮忙，远古的百兽战士大神月磨击败了欧陆克的领袖，而且封印了他。现在，欧陆克开始复苏，五个年轻人被圣兽认定。他们一定要放弃他们的现在生命而变成新一代的牙吠连者保护地球的和平。

2018年9月 —— 平凡的高中生们正在为各自的前途奋战。明光院景都正为了梦想的柔道金牌而努力，然而，他在比赛中受伤，从此再难踏上柔道选手之路。明光院心灰意冷之时，神秘的青年突然出现并拿出手表及驱动器……此外，班级里也突然来了一位名为海东大树的转学生……错综复杂的阴谋，层层交叠的陷阱。等待着明光院、庄吾还有月读的，究竟是什么样的未来