故事发生在民国时期，豪华别墅内居住着英俊帅气的男主人贺书明（罗彬 饰）及其乖巧的女儿丝丝。可惜女主人燕贞（张晓燕 饰）此前跳楼自杀，这件事不仅令家人痛不欲生，也在别墅内蒙上一层鬼魅恐怖的阴影。书明经常被噩梦和家里的诡异景象所困扰，丝丝则经常半夜里和妈妈在花海荡秋千。吃药治疗未果后，贺书明请来了擅长调查灵异事件的侦探上官天（齐志 饰）和开中药方的小妍（廖蔚蔚 饰）。针对侦探二人组的询问，男主人欲言又止，闪烁其词，而美丽女佣夏荷（杨紫彤 饰）似乎也有所顾忌，不敢直言。不知是人是鬼，上官和小妍权且展开抓鬼行动，在这一过程中他们逐渐发现鬼影背后的真相……

大清道光十七年，白草堂小医馆终于在广州番禺县开张。因为杨天淳周济穷苦百姓，故登门求医者络绎不绝。此时的若兰已经是杨天淳的好帮手，行医配药不在话下，猴拳三十六路如今也耍得有模有样。自从来到番禺县，杨天淳见识了鸦片的危害。他想不到此番毒流已经深入百姓骨髓，他第一次面对众多“毒虫”而束手无策。本是富甲一方的财主林万德被鸦片侵蚀得不成人形，万贯家财散尽一空，妻子已是目无光彩的疯女人，只有漂亮乖巧的小女儿林彩云照顾父亲前来治病。面对林万德不治身亡，杨天淳好不内疚！当晚噩梦连连，梦里还是那个模糊不清的古猿，可怖吼声，一爪朝他抓来！杨天淳惊醒，额头上的伤疤又呈撕裂之势！杨天淳猴性大发，若兰使出猴拳三十六路阻止，哪里是杨天淳的对手。若兰自保，躲进密室，就听着外面杨天淳的嘶吼。线人小猴子在密室双手掩目，也吓得发抖。次日，若兰和小猴子出了密室，医馆自然是一片狼藉。若兰一边收拾一边感叹，杨天淳究竟是何出身，伤疤又是从何而来，他的记忆为何始于一十三岁……杨天淳辫子散开，若兰为他梳头，杨天淳回忆自己的身世。杨天淳自少年时便在四川峨嵋派道观长大，师父乃是清音观“清音三子”之首的“铁鹰”杨西南。据师父所言，杨天淳渐渐知道，自己是在深山老林中被师父所捡，带回峨嵋派。掌门“清音掌”宇皓老道通过摸骨，得知这个孩子约有一十三岁，只是骨性奇特，异于常人，且不通人话，只会嘶叫！峨嵋派大部分师兄弟都称其为兽妖，须立即除掉，以免为人间后患。只有师父杨西南豁出性命保护，并立下誓言，收野孩子为徒，教化兽性，施予人为，如若不成，甘愿亲手杀之，自行滚出山门，永不再登峨嵋！就这样，杨西南给野孩子取名杨天淳，悉心教导，力图将他培养成人。杨西南云游四方，均带着天淳拜会各路名师，尤其是云南的猴拳大师郭炳耀。郭先生惊讶的发现杨天淳将猴拳耍得出神入化，而且精进百倍，甚至颠覆了他对猴拳的深层理解。渐渐地，杨天淳学会了说话，只是一直不熟练，导致口吃。但是，杨天淳生性顽皮，总是恶作剧，甚至贪酒撒疯，大闹道观，屡教不改。宇皓老道断定杨天淳兽性难驯，责令众徒齐手诛之！屠杀当晚，杨西南以自己的牺牲企图唤起天淳的人性。眼见师父毙命，本来恼羞成怒，准备大开杀戒的杨天淳跪倒在师父尸首旁，三天三夜不曾起身。宇皓老道感叹杨天淳的一片孝心，放他下山。杨天淳下山后本想自废武功，专心行医。恰巧路见不平，随即拔刀相助，救下了弱小。杨天淳感叹天下不公，何不用一身

北京城发生火药爆炸案！凶手在现场留下印记，要和“铁猴子”玩三个游戏，铁猴子杨天淳被玩的团团转，玉面龙到底是谁？真凶真正的目的竟然是调虎离山，抢劫八旗军饷，杨天淳得如何绝境反击呢？

杨天淳与辛若兰看戏回来之时发现有父母在苦寻自己失踪的子女。杨天淳迅速找到京城衙门询问情况。原来京城突然发生儿童失踪案，因为失踪的八个孩子都是富商子女，京城衙门最初以为是常见的绑架案，一直月余也不见绑匪前来索要赎金。杨天淳结合各种线索发现绑匪竟然是最近京城声名鹤起的“乱波幻术团”，“乱波幻术团”发请帖请各位富商带孩子来看表演，竟然在台上众目睽睽之下把孩子们都变没了。粘杆处曾找到京城各个变戏法、魔术吃饭的手艺人询问，这个幻术团表演手法均不是寻常的戏法、彩戏或魔术。当线索陷入困局之时，蒋子娇突然来到百草堂告诉杨天淳一个噩耗！龙山寺被灭门了！蒋子娇对杨天淳及若兰述说了当然她所见所闻，她与山上小和尚衍空和尚下山化缘逃过了灭门惨案，化缘回来之后曾经见过行凶者的身形，竟然是扶桑来的忍者！蒋子娇当时用遁形术逃过了忍者追杀，而小和尚衍空为了掩护蒋子娇牺牲了。听完蒋子娇的述说杨天淳随即动身快马加鞭赶往龙山寺，杨天淳一行人来到了被灭门的龙山寺，综合所有线索确定了忍者来次灭门的目的——为了龙山寺的武功秘籍，令人没想到的事，忍者突然袭击杨天淳一行人，并使用了幻术对付杨天淳，一番激斗之下，忍者众不敌杨天淳。杨天淳通过与忍者交手并结合在京城搜集到的证据，确认了京城绑架案亦是忍者所为。这些忍者都是被德川幕府剿灭的伊贺流忍者的遗孀，为了向德川幕府复仇证明忍者们的价值，来到中国寻根问祖的，而当年传下忍术的即是龙山寺东渡日本的被伊贺忍者奉为祖师的暗夜修罗，她们通过祖先及忍者头目雾隠才蔵告诉她们的传说，希望通过传说抓取童男童女来炼成传说中的式神，现在她们就差杨天淳的血液。杨天淳一行人为了引蛇出洞，回到了京城，纳兰索图告诉他们从日本派来了一位专门对抗忍者的武士——河上彦斋，杨天淳与河上彦斋碰面之后，河上彦斋仔细的告诉杨天淳关于日本忍者的武艺、修习、历史、所擅长的一切，并给杨天淳看了集忍术大成的秘籍《万川集海》，德川幕府曾惧怕忍者，而武士们不齿忍者下三滥、不荣誉的所为，德川幕府下令剿灭伊贺忍者集团，而河上彦斋就是杀死这些女忍者丈夫的人。弄清一切之后，杨天淳、河上彦斋等人迎战追踪而来的忍者众，在一片混战之中，铁猴子杨天淳准备变身对敌之时，河上彦斋竟然反身攻击铁猴子，把其制住逼入绝境，没想到河上彦斋就是末代伊贺流忍者雾隠才蔵！雾隠才蔵一只使用易容术化身河上彦斋，利用河上彦斋的身份弄清龙山寺传人是谁，现在他得到了杨

大清道光十六年，山东莱州府闹饥荒且瘟疫横行, 贫民百姓苦不堪言。潍县知县包智令搜刮民脂民膏。莱州知府尹不愁深夜亲临潍县衙门，只为皇上钦派的赈灾银不日将要抵达潍县。二人密谈届时将大部赈灾银中饱私囊之法. 忽然灯火霎时间被熄灭！屋外一声“铁猴子”几乎将二位贪官吓破了胆！县衙众兵力战带着猴子面具的大盗，却哪里是对手！被打得落花流水，也被铁猴子捉弄得颜面尽失。没一会儿功夫，潍县县衙被搞得七零八落，让包智令悲痛欲绝的是，他深藏于内阁的贪污赃银被铁猴子洗劫一空！当晚，无数灾民及穷苦百姓受到了铁猴子的救济。铁猴子原来是潍县人人皆知的“白草堂”医馆。而悬壶济世的杨天淳神医就是行侠仗义，扶危救困，劫富济贫的侠盗铁猴子！一日，杨天淳携医药箱来到潍县边界的“春凤楼”行医。是为一个妓女接生，此女名为辛若兰，生育时难产，若兰伤心欲绝，不想妓院狗腿即刻招呼若兰出外接客，竟还拳打脚踢。杨天淳已然出屋，但又不好出手，恐暴露铁猴子身份。杨天淳只得结结巴巴掏出银两，为若兰赎身。皇帝钦派的赈灾银在莱州境内被盗匪洗劫一空！纳兰索图证明，劫持皇银的正是潍县出名的盗匪铁猴子！如今皇帝命钦赐“玉面老虎”周世通前来潍县缉捕铁猴子，并且命令纳兰索图配合缉拿，将功补过。皇上下旨缉拿铁猴子，杨天淳非常生气，纳兰索图竟然血口喷人，陷害自己！杨天淳换上铁猴子装束，飞檐走壁，一副绳镖在高屋间荡来荡去，早就在屋顶埋伏的大内高手武三娘和高三戒与铁猴子大战，却根本不是铁猴子对手。铁猴子打败武三娘和高三戒，直取潍县县衙，并且和纳兰索图打在一起。此时，“玉面老虎”周世通赶到，铁猴子中了周世通的七星拳，身受重伤，情急之下撒出铁网，拿了纳兰索图回到药铺。铁猴子质问纳兰索图为何陷害自己，纳兰索图说是铁猴子劫了官银。铁猴子想一定是有人栽赃陷害，不等痊愈，整装外出调查，到了劫案现场，仔细查看。此时纳兰索图又发现劫匪铁猴子似乎很多地方并不像现在站在他眼前的铁猴子。便对若兰说一定是某人假扮铁猴子，故意留活口栽赃陷害。若兰见纳兰索图是个好官。放了纳兰索图。铁猴子在劫案现场仔细观察脚印，发现竟然是七星拳的步法习惯！原来是玉面老虎！此时，埋伏在此的武三娘和高三戒再次和铁猴子交手，高三戒毙命。武三娘被铁猴子的“寒流指”酷刑逼供，说出了周世通的阴谋和银子的下落。铁猴子回到药铺发现若兰放纳兰索图逃跑。铁猴子直奔潍县县衙。此时，纳兰索图已经回去。周世通怀疑纳兰索